More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0073 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  86.7 
 
 		 218 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  86.7 
 
 		 218 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  68.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  68.22 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  69.81 
 
 		 211 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  68.08 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  70.75 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  70.28 
 
 		 213 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  69.34 
 
 		 213 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  68.54 
 
 		 214 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  69.81 
 
 		 213 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  69.81 
 
 		 213 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  68.87 
 
 		 213 aa  271  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  69.34 
 
 		 213 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.67 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  47.39 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  53.24 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  46.01 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  46.45 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  43.4 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.75 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  44.93 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  50.7 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  49.05 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  43.4 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.28 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.97 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.57 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  51.04 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  50.23 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  43.66 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0584  lysine exporter protein LysE/YggA  45.58 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.46 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.69 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0969  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.95 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.49 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  39.81 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.49 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.03 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.15 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  41.46 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.94 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  39.13 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  39.51 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40.49 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40.49 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40.49 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40.49 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.21 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.86 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  38.21 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0776  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.87 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  41.55 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>