More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0356 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 203 aa  393  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  87.06 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  45.64 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2992  lysine exporter protein LysE/YggA  46.23 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  41.57 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  40.96 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.02 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 234 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.33 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  46.43 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  43.4 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.64 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  40.68 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.68 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.68 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.68 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  40.25 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.68 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.25 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.25 
 
 		 288 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.78 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.57 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.42 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.29 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.16 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  34.67 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  42.77 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  41.1 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  38.82 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  38.82 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  38.82 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  37.5 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  34.94 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  38.2 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.42 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  38.51 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.16 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.86 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  32.32 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.77 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.26 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  29.9 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.93 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  33.17 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  36.9 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  30.51 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 218 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.42 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  30.61 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.6 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.82 
 
 		 214 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  37.42 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.39 
 
 		 213 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  40.97 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 212 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>