More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1790 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.67 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  61.19 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 		 204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  58 
 
 		 205 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  62 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.9 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  56.72 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  60.42 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.88 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  57 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  54.68 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.74 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  52.68 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.01 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  47.26 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  50.5 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  50.49 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.77 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  47.52 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  47.52 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  41.71 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  41.71 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  39.68 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  41.21 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  42 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  39.09 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.21 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.71 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.26 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  38.54 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  39.2 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  39.2 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  39.2 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  39.2 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.38 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  38.38 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  38.38 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.38 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  38.38 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  38.38 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.88 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.39 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  38.89 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  34.76 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.88 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  31.82 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.42 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.58 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.91 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.02 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.02 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.48 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.72 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>