More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0298 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 202 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  99.5 
 
 		 202 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.72 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.41 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 		 203 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  52.97 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  47.52 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  52.69 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  52.5 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  52.36 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  48.74 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  50.98 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  49.5 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.73 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  48.74 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.5 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.74 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  46.34 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.41 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  46.53 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  39.9 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  39.39 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  39.39 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.36 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.3 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  38.38 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  38.89 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  38.38 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  38.38 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  38.38 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.14 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.09 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  36.18 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.95 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.47 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  34.38 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  30.65 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.85 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.76 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.93 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.93 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.27 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.93 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.93 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.93 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.93 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.52 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.85 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.17 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.24 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  42.55 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.47 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.93 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.5 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>