More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1160 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  64.25 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.02 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  57.89 
 
 		 209 aa  230  9e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.95 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  55.88 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  53.67 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  53.85 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.49 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  50.94 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.77 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  44.71 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.81 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  46.07 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  41.87 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  41.18 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40.2 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40.2 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.98 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.2 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  39.6 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  41.06 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  39.71 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  39.71 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  39.71 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  39.71 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.73 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.02 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  38.94 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 288 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.02 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.24 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37.91 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37.91 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.91 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37.91 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.91 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.91 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.64 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  35.21 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.91 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.44 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  36.18 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  42.05 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.11 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  39.32 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.5 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  35.41 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>