More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3344 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  82.38 
 
 		 210 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  77.62 
 
 		 210 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  77.14 
 
 		 210 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  77.14 
 
 		 210 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  76.67 
 
 		 210 aa  317  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  77.14 
 
 		 210 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  76.19 
 
 		 210 aa  313  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  66.19 
 
 		 210 aa  264  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.4 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  43.4 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.19 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.93 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.26 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  41.51 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.26 
 
 		 288 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.23 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  41.38 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  41.43 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  40.78 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.98 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  42.45 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.48 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  41.06 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.45 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.81 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 		 243 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  44.22 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  38.68 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  40.84 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  39.27 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.32 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  44.44 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.38 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.62 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.44 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  38.42 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  41.9 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.97 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.18 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.67 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.27 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.8 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.69 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.64 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.88 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.03 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.74 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  38.91 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.82 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  34.27 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.07 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  33.33 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  40.24 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>