More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0348 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  99.53 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  99.53 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  100 
 
 
211 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  99.53 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  99.53 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  100 
 
 
211 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  99.53 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  95.26 
 
 
211 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  81.04 
 
 
211 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  77.67 
 
 
213 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  80.75 
 
 
213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  80.75 
 
 
213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  80.28 
 
 
213 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  79.34 
 
 
213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  78.04 
 
 
214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  78.87 
 
 
213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  77.21 
 
 
213 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.57 
 
 
214 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.33 
 
 
218 aa  297  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.44 
 
 
218 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  68.69 
 
 
215 aa  288  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  53.77 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  47.39 
 
 
210 aa  198  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  46.34 
 
 
213 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  46.92 
 
 
211 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  44.84 
 
 
216 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.91 
 
 
218 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.45 
 
 
219 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  42.59 
 
 
217 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  41.51 
 
 
217 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  40.29 
 
 
209 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  52.08 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 
243 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  40.54 
 
 
217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.34 
 
 
206 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.18 
 
 
208 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  46.45 
 
 
211 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 
211 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0969  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.86 
 
 
218 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.49 
 
 
208 aa  141  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0584  lysine exporter protein LysE/YggA  44.29 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0776  lysine exporter protein LysE/YggA  50.23 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.68 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.67 
 
 
216 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
211 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 
206 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 
212 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 
225 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.43 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  39 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  39 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.5 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 
204 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
211 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.81 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 
205 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.09 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  39.6 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.3 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
208 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
208 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  38.12 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
227 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  38.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 
209 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  38.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
204 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  38.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
204 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  38.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 
242 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
208 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.5 
 
 
206 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 
204 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
207 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
209 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  34.43 
 
 
208 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 
210 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>