More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0784 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.69 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.43 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.88 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.59 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  53.21 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  55 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  53.27 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  51.23 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.36 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  49.76 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  50.47 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.72 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  38.92 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  40.69 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  41.23 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  41.62 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.18 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.5 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.13 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.63 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  39.09 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.86 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  39.11 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.09 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  33.01 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.56 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.51 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  35.15 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  35.15 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  35.15 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  35.15 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  36.1 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  35.1 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.66 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.66 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.66 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.66 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.66 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.66 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.66 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3569  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>