More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1992 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  79.13 
 
 		 206 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  51.92 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.48 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  50.49 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  47.52 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  47.52 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  47.52 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  47.03 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  46.53 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  45.54 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.04 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  43.2 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  47 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  44.72 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.52 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  45.54 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  45.54 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  45.54 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  45.54 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  49.51 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  42.31 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.06 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.58 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  43 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  41.63 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.4 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.36 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  43.92 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.25 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.88 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  41.72 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  41.26 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  44.19 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.04 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  42.03 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.64 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.64 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  38.54 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.34 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  36.46 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3569  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  36.55 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.8 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  38.73 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  40.58 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.9 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.07 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.61 
 
 		 243 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>