More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0823 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.29 
 
 
209 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  55.39 
 
 
208 aa  205  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.08 
 
 
208 aa  194  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.96 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.28 
 
 
210 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.81 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  48.8 
 
 
207 aa  188  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 
212 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 
206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  48.08 
 
 
209 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 
206 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  47.25 
 
 
218 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  44.29 
 
 
208 aa  174  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  41.9 
 
 
207 aa  174  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  45.33 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  45.5 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
204 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
227 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  46.89 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 
204 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
204 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  43.6 
 
 
207 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 
204 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40.8 
 
 
204 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40.8 
 
 
204 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  40.3 
 
 
204 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.7 
 
 
204 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 
208 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  40.86 
 
 
206 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
211 aa  141  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40.2 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40.2 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40.2 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40.2 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 
207 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 
210 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 
210 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
211 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.68 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.2 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.62 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  36.62 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.28 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.67 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
217 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.69 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.26 
 
 
218 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 
211 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  38.69 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.19 
 
 
204 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 
205 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.66 
 
 
209 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
207 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 
208 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 
209 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.93 
 
 
210 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.11 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.67 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.38 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.08 
 
 
208 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  35.18 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
203 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.1 
 
 
288 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
211 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
210 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 
223 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.75 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.75 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.75 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.55 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  38.62 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>