More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0976 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.21 
 
 
232 aa  347  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
210 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  71.43 
 
 
210 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  72.33 
 
 
213 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  68.12 
 
 
243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  68.1 
 
 
210 aa  280  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
210 aa  278  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
210 aa  278  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.67 
 
 
210 aa  278  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.76 
 
 
210 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.57 
 
 
210 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.76 
 
 
288 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  66.99 
 
 
210 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  68.66 
 
 
215 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  66.19 
 
 
212 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
234 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.4 
 
 
211 aa  272  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  68.16 
 
 
215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  68.16 
 
 
215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.93 
 
 
210 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  65.71 
 
 
210 aa  267  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  69.95 
 
 
194 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.52 
 
 
211 aa  266  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.67 
 
 
210 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  63.33 
 
 
210 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  66.17 
 
 
210 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  65.24 
 
 
210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  60 
 
 
215 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  56.19 
 
 
212 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.57 
 
 
215 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  57.62 
 
 
214 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  56.63 
 
 
212 aa  223  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  54.37 
 
 
211 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.92 
 
 
211 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.24 
 
 
210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  52.06 
 
 
215 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  52.06 
 
 
215 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  52.06 
 
 
215 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  51.55 
 
 
229 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  51.03 
 
 
215 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  51.55 
 
 
215 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.24 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.35 
 
 
198 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.63 
 
 
210 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 
210 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  40.95 
 
 
210 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 
210 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.93 
 
 
210 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.21 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  36.62 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  43.64 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.53 
 
 
223 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.94 
 
 
212 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
213 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  29.81 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  34.62 
 
 
208 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
219 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 
207 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34.78 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  38.22 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  39.77 
 
 
213 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37 
 
 
213 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  29.86 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.31 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.31 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.31 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
206 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 
209 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.68 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  45.73 
 
 
211 aa  111  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.84 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.84 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.84 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.84 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
206 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 
208 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.38 
 
 
211 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
208 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>