More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5636 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.08 
 
 
209 aa  279  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.96 
 
 
208 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
211 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.12 
 
 
203 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  42.63 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  41.74 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.19 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  39.71 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 
208 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  39.9 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
205 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 
208 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
206 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 
218 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 
210 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
206 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.15 
 
 
210 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
210 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  45.32 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.95 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  38.05 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.95 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  39.41 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.95 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  39.41 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.95 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.95 
 
 
211 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.95 
 
 
211 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.43 
 
 
223 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.95 
 
 
211 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  41.97 
 
 
208 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  39.41 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  38.86 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  45.81 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  32.06 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.18 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
210 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
288 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
216 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.95 
 
 
215 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.83 
 
 
211 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.6 
 
 
232 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
208 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
208 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  44.6 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  41.09 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  38.35 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  38.92 
 
 
194 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  36.19 
 
 
210 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  35.94 
 
 
210 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  38.92 
 
 
194 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  38.92 
 
 
194 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  38.92 
 
 
194 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
211 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  38.32 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  36.67 
 
 
209 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.75 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  38.74 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.74 
 
 
219 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>