More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4686 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
216 aa  420  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.97 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.51 
 
 
212 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.5 
 
 
199 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.04 
 
 
209 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  48.47 
 
 
215 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  44.5 
 
 
206 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.54 
 
 
216 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  41.49 
 
 
242 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  40.67 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  40.67 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.87 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  40.67 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  40.67 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.78 
 
 
208 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  40.67 
 
 
211 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  40.67 
 
 
211 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.67 
 
 
211 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  42.49 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  43.16 
 
 
209 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  43.16 
 
 
209 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2105  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.4 
 
 
211 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  40.43 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  40.43 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.86 
 
 
217 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 
210 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.28 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.76 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.07 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
210 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  41.15 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
208 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.54 
 
 
210 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.05 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.05 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.07 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
208 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
208 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
232 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
208 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  37.56 
 
 
204 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
211 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 
213 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.89 
 
 
230 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
207 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
207 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
214 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
204 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  39.25 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 
208 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
207 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.95 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
217 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 
194 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.72 
 
 
206 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.95 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
210 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  36.45 
 
 
210 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
214 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
243 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 
211 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
212 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  44.67 
 
 
215 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 
213 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.08 
 
 
210 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.91 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 
203 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  35.27 
 
 
208 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
213 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
211 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>