More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6008 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  96.15 
 
 		 208 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  77.16 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  77.16 
 
 		 208 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  77.16 
 
 		 208 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  75.63 
 
 		 242 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  76.65 
 
 		 208 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  75.25 
 
 		 209 aa  290  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  75.25 
 
 		 209 aa  290  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  49.52 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  44.81 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.87 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  43.87 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  43.4 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.2 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.68 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  38.86 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.86 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  38.86 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  44.31 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  44.31 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  38.76 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  37.56 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.39 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  38.39 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  38.39 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  38.39 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  43.71 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  44.23 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  40.57 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.6 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.21 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.14 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  39.25 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  38.86 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  39.72 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  40.3 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  40.3 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  40.3 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.3 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.16 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.24 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04781  hypothetical protein  43.08 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05656  hypothetical protein  43.08 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40.64 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33.98 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  36.45 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  39.67 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.65 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.01 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  33.99 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  33.99 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  35.96 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.35 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  33 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.88 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 204 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>