More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2900 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
209 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.08 
 
 
211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.77 
 
 
208 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.95 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 
210 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 
210 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.65 
 
 
210 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 
211 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.46 
 
 
216 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.81 
 
 
211 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 
211 aa  134  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.85 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.05 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.71 
 
 
215 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.68 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.85 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.74 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  40.64 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.44 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.97 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.47 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.47 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.47 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.47 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.47 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.47 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.47 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.77 
 
 
223 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 
218 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
218 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  43.41 
 
 
210 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
214 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
210 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  42.44 
 
 
210 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
210 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.6 
 
 
206 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
209 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
209 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  38.14 
 
 
215 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.38 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.94 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 
211 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.38 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 
211 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 
211 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 
207 aa  118  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.7 
 
 
208 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  34.02 
 
 
219 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  34.02 
 
 
219 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.27 
 
 
232 aa  117  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.98 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  33.51 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
234 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.62 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.01 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 
208 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  36.9 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  36.9 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  36.9 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 
288 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.4 
 
 
211 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  33.51 
 
 
219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  33.65 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  32.04 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.86 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.18 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>