More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  96.67 
 
 		 210 aa  339  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  61.76 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  52.2 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.07 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0506  lysine exporter protein LysE/YggA  54.73 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  45.55 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  46.07 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  46.07 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.41 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0810  LysE family protein  48.42 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.81 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0610  LysE family protein  47.37 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2117  LysE family protein  46.84 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2203  LysE family translocator protein  47.37 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  42.05 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  41.87 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1569  LysE family protein  46.84 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2032  LysE family translocator protein  46.84 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0712  LysE family translocator protein  46.84 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 203 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.93 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.28 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.11 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.26 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.17 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  37.56 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.63 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.14 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  34.85 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  31.71 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.96 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.63 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.79 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.52 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  33.98 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.53 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>