More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4074 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  100 
 
 		 215 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  67.3 
 
 		 214 aa  284  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.62 
 
 		 210 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.45 
 
 		 288 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.75 
 
 		 215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  60.48 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  58.1 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  57.62 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  60.61 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  55.71 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60 
 
 		 209 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  58.71 
 
 		 215 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  58.71 
 
 		 215 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.21 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  58.21 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.71 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.1 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.52 
 
 		 232 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  59.52 
 
 		 210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  55.24 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  61.11 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  56.04 
 
 		 243 aa  231  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.98 
 
 		 211 aa  231  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  55.24 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  55.71 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  55.56 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  56.22 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  57.59 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.71 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.4 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  54.87 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.55 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.02 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.57 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  48.97 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  48.21 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  48.21 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  47.94 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  48.97 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.07 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.06 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.58 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.44 
 
 		 209 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.14 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.07 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  41.1 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  37.64 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.63 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.17 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34.55 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  33.85 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  40.25 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  34.3 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.24 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  36.55 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.35 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.34 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.35 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.81 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>