More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3720 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
213 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  92.96 
 
 
213 aa  362  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  79.34 
 
 
213 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  71.36 
 
 
213 aa  291  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  51.17 
 
 
213 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  51.17 
 
 
219 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  50.23 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  44.55 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.1 
 
 
211 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4554  lysine exporter protein LysE/YggA  46.45 
 
 
211 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  41.76 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
210 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  39.57 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.46 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  34.6 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  36.59 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 
210 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
203 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 
211 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
210 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
206 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.76 
 
 
210 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  37.99 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 
288 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  37.95 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.08 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
234 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 
215 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 
215 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  41.88 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.33 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  42.21 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  33.17 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  42.21 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  42.21 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  42.21 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  42.21 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.21 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  42.21 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
215 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.74 
 
 
208 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.94 
 
 
208 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.52 
 
 
209 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  41.29 
 
 
215 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.37 
 
 
218 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
213 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 
215 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 
208 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 
208 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
211 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.08 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  42.77 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 
212 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.37 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 
210 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  35.89 
 
 
208 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
216 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 
209 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
214 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.02 
 
 
212 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.26 
 
 
223 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.33 
 
 
204 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
227 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
204 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
204 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 
216 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.33 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>