More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6153 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  97.67 
 
 		 215 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  88.37 
 
 		 229 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  88.37 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  85.58 
 
 		 215 aa  363  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  57.14 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  58.76 
 
 		 210 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  56.94 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  56.7 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  55.24 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 		 210 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.15 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.14 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.33 
 
 		 288 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.33 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 		 210 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  53.66 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.61 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  54.73 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  56.77 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  56.19 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  56.25 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.96 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.17 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  53.61 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  52.38 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.64 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.05 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  51.02 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.06 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.72 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  48.21 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  48.11 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  43.88 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.69 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.31 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.76 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  32.28 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.26 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.55 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.23 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  29.52 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.83 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.08 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.37 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.83 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.83 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.64 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  35.53 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.23 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>