More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7707 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
215 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  90.23 
 
 
229 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  89.77 
 
 
215 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  85.58 
 
 
215 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  85.58 
 
 
215 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  85.58 
 
 
215 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  58.85 
 
 
210 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.62 
 
 
212 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  57.73 
 
 
210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  55.29 
 
 
213 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  54.29 
 
 
212 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  56.19 
 
 
210 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  54.29 
 
 
210 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.11 
 
 
211 aa  222  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 
210 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.67 
 
 
210 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.61 
 
 
211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  57.14 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.68 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 
215 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 
215 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.95 
 
 
288 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.95 
 
 
210 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  52.71 
 
 
243 aa  207  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.72 
 
 
210 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  54.69 
 
 
210 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  52.74 
 
 
234 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  54.69 
 
 
194 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  52.06 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.9 
 
 
232 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.05 
 
 
210 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  50.95 
 
 
210 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.03 
 
 
209 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  48.47 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.91 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  47.94 
 
 
215 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  48.11 
 
 
214 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
211 aa  171  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 
212 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 
211 aa  165  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.21 
 
 
210 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 
198 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 
210 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 
210 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
210 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
208 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 
210 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
210 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 
218 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.22 
 
 
215 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.19 
 
 
218 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  32.28 
 
 
210 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.83 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.95 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.62 
 
 
208 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  36.2 
 
 
213 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.14 
 
 
211 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  33.11 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.35 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.23 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  32.23 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.53 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.05 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.81 
 
 
219 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  32.95 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.66 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>