More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4218 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  58.54 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  57.56 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  57.56 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  56.59 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  57.56 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  56.1 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  54.69 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 288 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  51.71 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  52.36 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  52.88 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  51.04 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.04 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  51.83 
 
 		 210 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  52.08 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  48.02 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.52 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  49.48 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  50.52 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  50.52 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  49.26 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  51.04 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  48.77 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  48.77 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  47.64 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  50 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.24 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.92 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  45.36 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  43.14 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.23 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  44.2 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  44.75 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.64 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.49 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.48 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  42.21 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  35.29 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  39.72 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3853  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00256154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.33 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.84 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.33 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.33 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.33 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.33 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.33 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.33 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  41.1 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.13 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 		 243 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  28.86 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.39 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.78 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.88 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.55 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>