More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2078 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  97.62 
 
 		 210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  95.71 
 
 		 210 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  80.48 
 
 		 211 aa  335  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  76.08 
 
 		 210 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.62 
 
 		 210 aa  331  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  77.51 
 
 		 210 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  77.14 
 
 		 210 aa  324  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  77.36 
 
 		 215 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.29 
 
 		 288 aa  323  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.29 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  76.89 
 
 		 215 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  76.89 
 
 		 215 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  77.03 
 
 		 210 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  77.03 
 
 		 234 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.67 
 
 		 210 aa  314  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  74.64 
 
 		 212 aa  314  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  75.71 
 
 		 243 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  72.38 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  73.68 
 
 		 210 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  79.27 
 
 		 194 aa  307  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70 
 
 		 210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  72.38 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  72.38 
 
 		 210 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  68.42 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  72.33 
 
 		 209 aa  291  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.39 
 
 		 232 aa  287  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.24 
 
 		 210 aa  284  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  65.71 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  62.89 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  60.61 
 
 		 215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 		 211 aa  231  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  56.94 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  56.94 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  56.37 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  55.98 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  55.29 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.16 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  58.25 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.53 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  57.73 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.85 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.02 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.4 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.15 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.25 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.78 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  35.05 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.63 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.91 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.24 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  42.2 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.34 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.66 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  31.55 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.74 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.86 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  38.55 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.46 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  35.33 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  36.26 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.36 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.02 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.02 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>