More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0452 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  87.06 
 
 		 203 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2992  lysine exporter protein LysE/YggA  46.8 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  47.15 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.43 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  39.02 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.97 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.78 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.91 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.61 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.94 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.56 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.81 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  43.92 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.39 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.63 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  39.78 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.27 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  44.71 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  39.06 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.08 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.06 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.51 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  32.32 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.64 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  27.92 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  28.57 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  31.71 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  32.94 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  27.45 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.5 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.68 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  33.16 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.58 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.89 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>