More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0366 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  72.86 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  73.81 
 
 		 210 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  72.38 
 
 		 213 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.43 
 
 		 211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  73.81 
 
 		 210 aa  310  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  71.43 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.56 
 
 		 211 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  71.9 
 
 		 212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70 
 
 		 210 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  69.05 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  73.33 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  68.57 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  69.05 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  68.57 
 
 		 215 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  68.57 
 
 		 215 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  67.46 
 
 		 210 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  66.19 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  66.03 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  63.81 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  66.19 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  65.71 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  67.14 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.24 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  69.43 
 
 		 194 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.24 
 
 		 209 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.24 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  59.52 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  60.48 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  59.5 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  57.14 
 
 		 215 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  56.19 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  57.62 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  56.19 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  56.67 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.69 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.48 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  55.71 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  55.67 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  55.1 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.81 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.36 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  41.59 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.54 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  42.77 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.24 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  44.71 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2105  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.24 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  35.12 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.15 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.67 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.06 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.91 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  37.65 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  28.91 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  34.6 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  36.2 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  37.65 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.65 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>