More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2105 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2105  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
211 aa  416  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.61 
 
 
214 aa  205  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.19 
 
 
212 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.66 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.4 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.51 
 
 
216 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 
199 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  45.63 
 
 
206 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  51.05 
 
 
215 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
208 aa  138  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
208 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  40.93 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 
211 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  40.38 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.11 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  42.27 
 
 
207 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 
212 aa  131  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 
208 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
210 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.86 
 
 
208 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  39.8 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.92 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  44.08 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  39.8 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  39.8 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  40.3 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  41.08 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.5 
 
 
206 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 
208 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
210 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 
242 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.92 
 
 
232 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
203 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
211 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37.88 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37.88 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.88 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
234 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37.88 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
215 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
215 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  31.92 
 
 
210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
207 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  38.3 
 
 
243 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 
211 aa  121  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
215 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  39.8 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.39 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  39.8 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.32 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  39.8 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  39.8 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.39 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.92 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.39 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.39 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.82 
 
 
218 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.34 
 
 
210 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.86 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>