More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4659 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  98.08 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  99.52 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  97.46 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  95.96 
 
 		 209 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  95.96 
 
 		 209 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  76.44 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.44 
 
 		 208 aa  314  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  48.56 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.79 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.38 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.38 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  39.29 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  40.95 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.74 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.53 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  43.53 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  43.53 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  44.77 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  43.53 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  44.05 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  39.42 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  44.19 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.15 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.07 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.07 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  41.67 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  40.28 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.92 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.54 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  39.35 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  39.35 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  35.24 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  40.65 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.41 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.97 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  36.28 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  37.44 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  34.29 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  37.44 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.62 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.58 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.13 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 288 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.68 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.63 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.63 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  37.44 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.89 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  37.44 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>