More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0208 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  80.48 
 
 		 213 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  80.57 
 
 		 210 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  79.15 
 
 		 210 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  76.78 
 
 		 210 aa  327  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  76.3 
 
 		 210 aa  320  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.88 
 
 		 210 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.78 
 
 		 210 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.88 
 
 		 288 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  75.83 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  75.83 
 
 		 215 aa  313  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.3 
 
 		 210 aa  313  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  76.19 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  75.36 
 
 		 215 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  75.36 
 
 		 215 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  72.51 
 
 		 210 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  75.36 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.09 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  75.24 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  72.99 
 
 		 212 aa  307  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.77 
 
 		 210 aa  295  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  75.77 
 
 		 194 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  71.56 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  70.14 
 
 		 210 aa  285  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  65.88 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  65.88 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.88 
 
 		 210 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.4 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.93 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  60.51 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  57.14 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  54.98 
 
 		 215 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  57.07 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.69 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  53.08 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  51.66 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.84 
 
 		 215 aa  214  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  55.12 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.4 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.52 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.56 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.32 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.91 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.23 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.47 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.54 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.22 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.02 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.68 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.74 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  36.68 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.91 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  39.68 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  32.08 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  35.58 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.23 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  36.19 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>