More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4774 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  90.32 
 
 		 213 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  78.8 
 
 		 218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  74.19 
 
 		 208 aa  296  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  73.27 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  74.31 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  74.31 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  72.35 
 
 		 207 aa  285  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  70.97 
 
 		 207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  70.97 
 
 		 207 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0810  LysE family protein  68.2 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2203  LysE family translocator protein  68.66 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987401  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0610  LysE family protein  68.2 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2117  LysE family protein  68.2 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1569  LysE family protein  66.82 
 
 		 204 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2032  LysE family translocator protein  66.82 
 
 		 204 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0712  LysE family translocator protein  66.82 
 
 		 204 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  49.76 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  50.24 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  45.71 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0506  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.82 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.11 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.65 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 210 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.65 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.71 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  37.88 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.94 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.24 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.24 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.24 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.26 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  37.91 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  37.91 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  37.91 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  37.91 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.52 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  33.17 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.46 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.01 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  31.43 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  32.99 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.17 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.73 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.17 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  40.38 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.09 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  42.04 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.77 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.56 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  41.4 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  40.13 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.56 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.13 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  35.55 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.7 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.52 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>