More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0244 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  90.29 
 
 		 206 aa  351  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  86.41 
 
 		 206 aa  340  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  76.21 
 
 		 206 aa  333  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.76 
 
 		 206 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.76 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  74.27 
 
 		 206 aa  324  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  81.55 
 
 		 206 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  78.16 
 
 		 206 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  77.67 
 
 		 206 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  78.16 
 
 		 206 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  80.49 
 
 		 206 aa  315  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  80.49 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  78.16 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  80.49 
 
 		 206 aa  315  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  77.67 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  86.41 
 
 		 206 aa  313  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  51.96 
 
 		 205 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.76 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50.98 
 
 		 204 aa  221  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  45.15 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  45.1 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  46.12 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  46.12 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.38 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  44.61 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  43.96 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  42.51 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  43.63 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.13 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.79 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.38 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  43.69 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  41.63 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  45.03 
 
 		 224 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  40.19 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  43.35 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.77 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  45.02 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.42 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.23 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.48 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  39.51 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.98 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.84 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.99 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  34.63 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.45 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  37.56 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  33.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>