More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1798 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  58.85 
 
 
212 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  58.17 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  57.69 
 
 
231 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  54.33 
 
 
212 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  56.1 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  49.51 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.83 
 
 
208 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  48.51 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 
211 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  37.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  37.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  37.32 
 
 
210 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  37.32 
 
 
210 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
209 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 
206 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  37.91 
 
 
210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  36.84 
 
 
210 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  36.84 
 
 
210 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  36.84 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.07 
 
 
210 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  36.89 
 
 
208 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  35.92 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  36.41 
 
 
208 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  36.41 
 
 
208 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  35.44 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.66 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  34.95 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
209 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
217 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 
208 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
248 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  42.07 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.39 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.13 
 
 
213 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 
207 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.85 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 
206 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.63 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  34.27 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  29.21 
 
 
207 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
217 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  32.52 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 
211 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.02 
 
 
211 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 
218 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
225 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
211 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.88 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.7 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.83 
 
 
207 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
214 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.33 
 
 
211 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.63 
 
 
209 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.86 
 
 
209 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
210 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  31.16 
 
 
221 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.63 
 
 
206 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
210 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
209 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.49 
 
 
234 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.28 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  33 
 
 
209 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
213 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 
204 aa  104  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 
211 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
211 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  32.67 
 
 
209 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.02 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.5 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
207 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 
214 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>