More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5050 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  78.4 
 
 		 213 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.88 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  72.73 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  72.73 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  72.25 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  72.25 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  71.29 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  72.25 
 
 		 207 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  71.77 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0810  LysE family protein  67.94 
 
 		 241 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0610  LysE family protein  69.86 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2203  LysE family translocator protein  69.86 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2117  LysE family protein  68.42 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1569  LysE family protein  66.99 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0712  LysE family translocator protein  66.99 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2032  LysE family translocator protein  66.99 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  50.25 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  47.76 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  50.25 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0506  lysine exporter protein LysE/YggA  48.74 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.11 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  37.78 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  37.78 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  37.78 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.95 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  38.07 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  38.07 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  38.07 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  38.07 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.48 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.94 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.45 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  33.33 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.8 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  32.18 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.99 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.62 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  33.51 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.25 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  34.36 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.43 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  33.01 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.67 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  34.98 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>