More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4318 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.05 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  42.19 
 
 		 206 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.65 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  49.4 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  39.59 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.59 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.2 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.8 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  41.07 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.39 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.72 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.72 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.26 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.71 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.78 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  33.83 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.93 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  41.72 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.83 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  38.46 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.7 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.22 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  35.71 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.13 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.84 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  34.29 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  27.18 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  29.47 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  36.97 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  29.47 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.97 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  32.38 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.64 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.83 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.21 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>