More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4795 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  64.39 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  66.02 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  57.97 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  56.59 
 
 		 206 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.15 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  60.39 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  60.87 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  61.96 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  61.41 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  52.2 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  50.49 
 
 		 204 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  52.82 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  65.32 
 
 		 144 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.08 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  35.75 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35.75 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.27 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.82 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.55 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.98 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.95 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.18 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.88 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.88 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  36.93 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  33.01 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  30.1 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.5 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.43 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  36.46 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  31.4 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  35.05 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  32.69 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.82 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  33.18 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.92 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.78 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>