More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3092 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  62.32 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.39 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.87 
 
 		 211 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.6 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  53.88 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  54.9 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  51.46 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.52 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  51.44 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  54.76 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.99 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  43.54 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  51.81 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  50.6 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  50.6 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  50 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  50 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  50 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  50 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.93 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.93 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.26 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.78 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.46 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  48.02 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.31 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  49.4 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.03 
 
 		 159 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.55 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  32.37 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  37.56 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  35.18 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  39.05 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.47 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.18 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.1 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  38.29 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  36.07 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  36.36 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.57 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.57 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.57 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.82 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.47 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.92 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.18 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.63 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  35.71 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  39.31 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.63 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.6 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  32.39 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.63 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.29 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.67 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.69 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  39.73 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>