More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0092 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
211 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  45.02 
 
 
211 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
203 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 
213 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.6 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 
213 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.08 
 
 
204 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 
205 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 
208 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.9 
 
 
206 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 
208 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.36 
 
 
206 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
210 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.86 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.54 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.86 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 
212 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
211 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
208 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 
211 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.65 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.65 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
210 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.38 
 
 
206 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.67 
 
 
207 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.54 
 
 
206 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
205 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.45 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  36.45 
 
 
213 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  33.51 
 
 
207 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 
233 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.57 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36 
 
 
206 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
203 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.33 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  35.41 
 
 
218 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  33.83 
 
 
209 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
212 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.97 
 
 
206 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
207 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  35.12 
 
 
210 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.83 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  33.83 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
210 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.75 
 
 
206 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
222 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
222 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
206 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 
212 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
199 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.83 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 
208 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
206 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.98 
 
 
216 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.8 
 
 
222 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
205 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
217 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
210 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.68 
 
 
211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 
207 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
207 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.63 
 
 
209 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
205 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.61 
 
 
211 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>