More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1344 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 
208 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
205 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.42 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 
204 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
206 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  33.13 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  33.13 
 
 
207 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
210 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  32.53 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
215 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  32.53 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  32.53 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  32.53 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  33.13 
 
 
207 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.91 
 
 
212 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  30.41 
 
 
206 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 
213 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 
205 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.59 
 
 
208 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  36.19 
 
 
207 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.32 
 
 
204 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
208 aa  101  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.26 
 
 
205 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
207 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.12 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.9 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
204 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
159 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  33.53 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.81 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.81 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.09 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.48 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.18 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  33.73 
 
 
207 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.33 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.33 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.33 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.11 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.32 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  35.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  35.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  35.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  35.19 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.53 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  35.19 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  33.33 
 
 
215 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
208 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  31.07 
 
 
210 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.72 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.46 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  35.46 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  35.46 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.23 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  29.63 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 
210 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
210 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  28.05 
 
 
203 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 
207 aa  89  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
211 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.51 
 
 
225 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.75 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.07 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  26.15 
 
 
211 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>