More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2444 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  47.78 
 
 
207 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1597  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 
207 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  36.45 
 
 
207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 
207 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 
207 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 
207 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.54 
 
 
207 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0741  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 
209 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.664239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 
207 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 
208 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.98 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
207 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.77 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
211 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.83 
 
 
209 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
211 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
210 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
206 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.04 
 
 
206 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 
212 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34 
 
 
206 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31 
 
 
205 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.15 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  33 
 
 
209 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 
209 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
208 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.18 
 
 
206 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.3 
 
 
206 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  30.81 
 
 
203 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.33 
 
 
209 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  28.77 
 
 
218 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.81 
 
 
222 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.84 
 
 
204 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
207 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.64 
 
 
206 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
213 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  27.4 
 
 
222 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  34.47 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.5 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.68 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  27.8 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  27.8 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.18 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.19 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.19 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.37 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.18 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.19 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  31.86 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.34 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.85 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  26.98 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  32.51 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.09 
 
 
209 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
210 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
207 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.29 
 
 
211 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
210 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>