More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2802 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
212 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  83.65 
 
 
208 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  55.02 
 
 
210 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  54.41 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  54.41 
 
 
209 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  53.59 
 
 
210 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  53.11 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  50.48 
 
 
210 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  54.55 
 
 
210 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.43 
 
 
210 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 
210 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  47.83 
 
 
209 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  47.6 
 
 
209 aa  177  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.79 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.31 
 
 
206 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.38 
 
 
207 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  44.23 
 
 
206 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.87 
 
 
206 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  44.71 
 
 
206 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.87 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.31 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.31 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  47.83 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.38 
 
 
206 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.83 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.83 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.35 
 
 
206 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.31 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.31 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.35 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.35 
 
 
206 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  37.2 
 
 
205 aa  157  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  43.54 
 
 
206 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.33 
 
 
213 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.35 
 
 
204 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 
205 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.13 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.27 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  41.47 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  44.23 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
207 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  36.23 
 
 
207 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
207 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.98 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
210 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
212 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.11 
 
 
212 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  39.25 
 
 
214 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
212 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 
208 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
212 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
213 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 
211 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 
208 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 
212 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 
208 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
205 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 
211 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
203 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 
233 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
211 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
207 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
211 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  36.78 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  36.78 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 
212 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 
206 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.62 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
211 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
211 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.86 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>