More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3615 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
208 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  83.65 
 
 
212 aa  324  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  55.88 
 
 
210 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  54.41 
 
 
209 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  55.39 
 
 
210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  53.92 
 
 
209 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  55.39 
 
 
210 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  52.2 
 
 
210 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  55.88 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  52.2 
 
 
210 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.71 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  55.43 
 
 
224 aa  194  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  49.5 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  49.02 
 
 
209 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  49.26 
 
 
209 aa  167  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.35 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  46.56 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.79 
 
 
206 aa  160  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  160  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.5 
 
 
206 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.39 
 
 
206 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.87 
 
 
206 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.79 
 
 
206 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.79 
 
 
206 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.38 
 
 
206 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.38 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.62 
 
 
204 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.42 
 
 
206 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 
206 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.89 
 
 
206 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.31 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  41.51 
 
 
217 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 
213 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  35.64 
 
 
205 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.14 
 
 
205 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.41 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 
205 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.35 
 
 
206 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  46.56 
 
 
206 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  43.27 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.27 
 
 
212 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 
207 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  41.23 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  34.48 
 
 
207 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 
209 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
212 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.67 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 
208 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
211 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
209 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
203 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 
208 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 
212 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  35.15 
 
 
203 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
211 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
213 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
207 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
205 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  37.71 
 
 
233 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
211 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 
204 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  37.36 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
203 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
211 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  37.22 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  36.78 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  36.78 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.77 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.02 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.4 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
218 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>