More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  100 
 
 
209 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  99.04 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  72.12 
 
 
210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  70.48 
 
 
210 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  72.95 
 
 
210 aa  288  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  71.5 
 
 
210 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  70.48 
 
 
210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  79.81 
 
 
224 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
210 aa  284  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  70 
 
 
210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  55.56 
 
 
209 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  56.67 
 
 
209 aa  204  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 
212 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 
208 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  46.12 
 
 
206 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  41.95 
 
 
205 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.98 
 
 
204 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  48.44 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.96 
 
 
205 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  48.7 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  41.98 
 
 
206 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.11 
 
 
206 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.51 
 
 
206 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.97 
 
 
213 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  44.5 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.86 
 
 
213 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.31 
 
 
206 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.31 
 
 
206 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  43.33 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.6 
 
 
206 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.6 
 
 
206 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.13 
 
 
206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.6 
 
 
206 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.13 
 
 
206 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  44.66 
 
 
206 aa  154  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
207 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  41.06 
 
 
207 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 
214 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 
214 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  47.92 
 
 
206 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 
209 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  43.81 
 
 
205 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
217 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  46.35 
 
 
212 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
210 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.35 
 
 
212 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.03 
 
 
207 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 
207 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  47.34 
 
 
212 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  38.32 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
206 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
205 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 
211 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.12 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  34.04 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 
211 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.85 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  34.95 
 
 
206 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.03 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 
212 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.83 
 
 
209 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
203 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 
208 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
209 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
210 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.43 
 
 
222 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
211 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.43 
 
 
222 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
206 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
213 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
211 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 
204 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 
211 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.43 
 
 
222 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
203 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 
203 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
212 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 
208 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.42 
 
 
218 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 
207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
205 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>