More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2136 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
212 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  45.93 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.89 
 
 
211 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.42 
 
 
211 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  44.98 
 
 
233 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 
215 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  46.23 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 
211 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  45.28 
 
 
210 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  45.28 
 
 
210 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  41.43 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.5 
 
 
212 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  44.29 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.58 
 
 
208 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.48 
 
 
206 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  45.54 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.75 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  40.5 
 
 
203 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  38.68 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
203 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
206 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.11 
 
 
208 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.69 
 
 
211 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
203 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
212 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 
218 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  38.55 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.48 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.43 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.34 
 
 
207 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.44 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.27 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.44 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 
208 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  38.25 
 
 
213 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
212 aa  118  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.38 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  40.55 
 
 
208 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.02 
 
 
206 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40 
 
 
206 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  38.5 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  39.32 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.23 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.57 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.57 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.23 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.57 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.11 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  35.05 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.49 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.23 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
207 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.75 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 
213 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 
212 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
203 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
209 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
211 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
213 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
210 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.48 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  36.27 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  37.38 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.88 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  36.27 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  39.74 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.26 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  37.37 
 
 
209 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.05 
 
 
222 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 
209 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  37.37 
 
 
209 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  36.76 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 
208 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
209 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.15 
 
 
213 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  35.81 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>