More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3633 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
207 aa  403  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  77.78 
 
 
207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  42.31 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 
210 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  42.03 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  43.27 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.71 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  42.03 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.27 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.18 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 
210 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.18 
 
 
206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.69 
 
 
206 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.18 
 
 
206 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.98 
 
 
206 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.69 
 
 
206 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 
204 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 
212 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.76 
 
 
205 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  41.46 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
210 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.69 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  40.49 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 
207 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  36.1 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.71 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  38.92 
 
 
208 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  40.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  40 
 
 
209 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
211 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  40.2 
 
 
206 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.26 
 
 
213 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
216 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
217 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
209 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  38.41 
 
 
208 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.95 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.41 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 
212 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  33.68 
 
 
210 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  33.16 
 
 
210 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.79 
 
 
213 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 
214 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  33.68 
 
 
210 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  33.16 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  33.16 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.2 
 
 
212 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  33.68 
 
 
210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.68 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 
208 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  32.82 
 
 
209 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 
218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 
214 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  33.16 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 
213 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.18 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
217 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 
209 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 
212 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
210 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 
213 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
203 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.11 
 
 
210 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
213 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
210 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.5 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
238 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.96 
 
 
212 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>