More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0227 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  98.58 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  95.73 
 
 
211 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  91.08 
 
 
213 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  88.68 
 
 
212 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  95.26 
 
 
211 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  95.26 
 
 
211 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  81.99 
 
 
211 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  81.52 
 
 
211 aa  345  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  80.54 
 
 
218 aa  345  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  78.38 
 
 
222 aa  344  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  78.38 
 
 
222 aa  344  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  79.28 
 
 
222 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  71.56 
 
 
218 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  51.43 
 
 
208 aa  207  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  49.26 
 
 
208 aa  187  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  49.03 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.92 
 
 
207 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.5 
 
 
208 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.27 
 
 
208 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
212 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.06 
 
 
208 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.92 
 
 
213 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
208 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.9 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
207 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
207 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  40.87 
 
 
203 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.42 
 
 
207 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 
207 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
207 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.97 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.87 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
208 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.02 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 
206 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.18 
 
 
230 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.84 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.02 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.02 
 
 
206 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.7 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 
224 aa  118  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  37.38 
 
 
208 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.21 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
206 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
204 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 
203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.24 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.12 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  33.02 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
210 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.47 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.84 
 
 
206 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.12 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.12 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.12 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  37.91 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
206 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 
211 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
209 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
209 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 
209 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>