More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1199 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
203 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  71.92 
 
 
204 aa  299  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.98 
 
 
204 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  65.85 
 
 
207 aa  268  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  67 
 
 
203 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 
205 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  54.46 
 
 
220 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  51.49 
 
 
205 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.98 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  55.17 
 
 
204 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.41 
 
 
205 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  53.4 
 
 
203 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  49.5 
 
 
203 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  51.74 
 
 
202 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 
204 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 
203 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.71 
 
 
204 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  46.77 
 
 
204 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  48.13 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.77 
 
 
203 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  46.8 
 
 
210 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  46.73 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  46.73 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.83 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
206 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
204 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.5 
 
 
204 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.33 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.17 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
211 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
204 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
204 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.18 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
218 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36 
 
 
204 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
218 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  34.57 
 
 
206 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
217 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.16 
 
 
213 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.15 
 
 
208 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
207 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  36.36 
 
 
209 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
216 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.35 
 
 
211 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 
209 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.99 
 
 
206 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.47 
 
 
205 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.31 
 
 
206 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.95 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
216 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.79 
 
 
206 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
207 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 
208 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 
208 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.78 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  33.5 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.96 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.28 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.5 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>