More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1667 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  72.86 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  72.38 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  64.81 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  71.9 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  66.35 
 
 		 214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.75 
 
 		 213 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  63.98 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.08 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  41.92 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.92 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  44.12 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.93 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  44.33 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  43.06 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.72 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.88 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.75 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.23 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  42.29 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.63 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  46.03 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.69 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  41.31 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  41.9 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  39.9 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  37.69 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.93 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.69 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  43.27 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  38.16 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.21 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.5 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.5 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.5 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.5 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.5 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.5 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.5 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  41.06 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.68 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.52 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.84 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.84 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.84 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.16 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  32.43 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>