More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1618 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  45.24 
 
 
210 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.5 
 
 
211 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  43.54 
 
 
208 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.5 
 
 
211 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.02 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 
208 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
211 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  43.04 
 
 
215 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 
205 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  43.03 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  43.03 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  42.42 
 
 
207 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  42.42 
 
 
207 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  42.42 
 
 
207 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  42.33 
 
 
207 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  42.42 
 
 
207 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.87 
 
 
159 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 
203 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.65 
 
 
203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 
208 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
209 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  36.77 
 
 
240 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
206 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 
213 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  38.33 
 
 
207 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
211 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.8 
 
 
206 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
203 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.98 
 
 
206 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
204 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 
206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 
206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 
206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.68 
 
 
204 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.08 
 
 
211 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.8 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.22 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 
206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.03 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  33.66 
 
 
209 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.13 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.19 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.88 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  32.5 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  32.5 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.97 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.34 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.22 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  35.79 
 
 
255 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.54 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  29.74 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.62 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.62 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
208 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.62 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.71 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  42.48 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  38.1 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  41.82 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>