More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2220 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  84.51 
 
 
213 aa  360  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  84.51 
 
 
213 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  83.57 
 
 
213 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
211 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
208 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 
211 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.91 
 
 
207 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
205 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.54 
 
 
208 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.99 
 
 
212 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
203 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  40.74 
 
 
215 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
212 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.58 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.75 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
211 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 
212 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
213 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
233 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.18 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.97 
 
 
216 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
203 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.36 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 
208 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 
207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.67 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 
208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 
208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 
207 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.38 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  32.51 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.06 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
207 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  33.99 
 
 
205 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.15 
 
 
210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 
230 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
214 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 
207 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 
209 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  29.38 
 
 
210 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
209 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
207 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.41 
 
 
210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  29.38 
 
 
210 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.33 
 
 
211 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  39.25 
 
 
215 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 
210 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
207 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.15 
 
 
210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
209 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.76 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
217 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  34.21 
 
 
206 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.98 
 
 
204 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  34.25 
 
 
183 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>