More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4610 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  94.79 
 
 		 211 aa  358  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  94.29 
 
 		 210 aa  357  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  94.29 
 
 		 210 aa  357  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  93.81 
 
 		 210 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  68.87 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.77 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.3 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.15 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  62.44 
 
 		 215 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  64.73 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  52.63 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.29 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  38.73 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  40.85 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  40.29 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.58 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  41.03 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  39.91 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  36.67 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.92 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  37.23 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.24 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.04 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.67 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  39.36 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.24 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  38.53 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.49 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.04 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1597  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0741  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.664239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.4 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.32 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.86 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  32.12 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.92 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.92 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.43 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35.6 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  34.62 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  41.77 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.92 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  32.16 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.57 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  39.76 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  35.87 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  36.17 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.73 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>