More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2878 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.35 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.35 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  38.33 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  30.2 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  35.33 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.91 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 207 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 206 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.69 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  42.13 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.69 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  41.01 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  38.93 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.8 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  31.16 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.65 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  28.93 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  32.85 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  27.64 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.73 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  31.09 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.43 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  25.23 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  25.23 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  25.23 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  25.23 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  24.52 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.23 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  25.23 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  35.09 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  32.93 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.94 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.14 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  32.2 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.22 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.06 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.93 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  24.4 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25.47 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>