More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0328 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.18 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  41.44 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  35 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  41.44 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  36.93 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  36.11 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.43 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.66 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  34.83 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.95 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.69 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.73 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.65 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.73 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  38.67 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.42 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31.87 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1597  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  36.05 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.86 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.2 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.71 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  29.33 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  36.94 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.26 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.88 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  27.72 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  36.92 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.64 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.38 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  34.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.78 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.63 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.63 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.29 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>